植物保护专业是中央财政支持的重点专业，也是学院办学历史最悠久和就业对口率最高的专业之一。
本专业培养具有良好的社会主义价值观，具备现代企业优秀文化理念，能从事植物病虫害防治设计、有经营和管理能力的高端技能型专门人才。
主干课程有：农林有害生物识别技术、农作物有害生物防治、园艺植物有害生物防治技术、植物化学保护、农资经营等。
学生毕业后在农业、园艺和园林部门，农化企业，农资企业和管理单位从事植物保护方面的技术推广、检验、执法监督工作，还可在各级各类口岸、海关等从事植物检疫工作。
学生参与教师课题—万州猕猴桃溃疡病发生规律及综合防治技术研究