该专业为安徽省重点建设学科，2003年获准硕士学位授予权，2010年获准工程硕士授予权；建有教育部生物膜法水质净化及利用技术工程研究中心，设有两项安徽省三联泵业奖学金。
培养目标：培养具备水、气、声和固体废物等污染防治、环境规划和资源保护等基础知识，具有污染控制工程、给排水工程和环保设备的设计及运营管理能力，能够为政府环保部门、生产管理一线提供有关环保的规划管理、科研开发、工程设计、施工管理等方面综合素质和技能的高级技术人才。
主要课程：无机化学、有机化学、分析化学、物理化学、工程测量学、流体力学、环境污染物迁移的数学模型、环境微生物学、环境监测、水污染控制工程、大气污染控制工程、固体废物处理与处置、环境质量评价与系统分析、冶金资源综合利用、环境规划与管理、给排水管网工程、现代三维设计技术等。
就业方向：政府环保部门、设计单位、工矿企业、科研单位、高等学校等。