生物工程专业本专业培养掌握生物技术及其产业化的科学原理、工艺技术过程和工程设计等基础理论、基本技能，能在生物技术与工程领域从事设计、生产、管理和新技术研究、新产品开发的工程技术人才。
主要专业课程有：有机化学、生物化学、微生物学、细胞生物学、化工原理、生化工程、生物工艺学、发酵设备、发酵工程、生物工艺学、细胞工程、酶工程、环境生物工程、生态工程学、生态与环境评价、废水生物处理等。