植物保护专业：授予农学学士学位培养目标：植物保护是研究植物生产中病虫草等有害生物的种类识别、生物学特性、发生危害规律及其防治理论和防治技术的综合性学科，是保护国家农业生产安全、保障农产品质量安全、减少环境污染、维护公众健康，促进农业可持续发展的重要科技支撑。
本专业是首批江西省品牌专业，奠基人为1955年当选为中国科学院学部委员（院士）的杨惟义教授。
本专业拥有江西省“十二五”重点学科1个(植物保护学科)、二级学科博士点1个(作物保护)、一级学科硕士点1个(植物保护)、二级学科硕士点4个(动物学、植物病理学、农业昆虫与害虫防治、农药学)和省级优秀教学团队1个(农业昆虫与害虫防治教学团队)。
该专业培养具有坚实的生命科学基础，掌握植物保护、农药科学与技术的基础理论、基本技能的宽口径、复合型高级科技人才。
主干课程：植物生理与生物化学、遗传学、现代生物技术、普通昆虫学、农业昆虫学、植物病理学、农药学、资源昆虫学、城市昆虫学、有害生物综合治理等。
毕业去向：毕业生可在政府、农业、商贸及其他相关企事业单位从事公共管理、有害生物综合治理、农药经营与研发、教学及科研等工作。
优秀毕业生可推荐免试攻读硕士学位。
植物保护（动植物检疫方向）专业：授予农学学士学位培养目标：本专业方向是为适应动植物产品国际贸易迅猛发展及有害生物的控制而设立的，以“十二五”省级重点一级学科(植物保护学科)、二级学科博士点(作物保护)、一级学科硕士点(植物保护)、二级学科硕士点(动物学、植物病理学、农业昆虫与害虫防治、农药学)为依托，培养掌握动植物检验检疫的基础理论和法规，具备进行有害生物的检测鉴定、控制有害生物入侵蔓延、综合治理有害生物的基础知识和基本技能的复合型高级科技人才。
主干课程：基础生物化学、微生物学、分子生物学、病毒学、动物学、昆虫学、动植物检验检疫、动植物检验检疫法规、农药与兽药残留分析检验、有害生物综合治理、国际贸易等。
毕业去向：毕业生可在海关、口岸等国家各级动植物检验检疫部门，农产品出口基地、进出口贸易公司及其它相关企事业单位，从事出入境检验检疫、有害生物控制、动植物资源保护和可持续利用等方面的技术、管理工作及教学、科研工作。
优秀毕业生可推荐免试攻读硕士学位。