生物制药技术专业有重庆市财政局和市教委资助的生物制药技术实训基地，建有中药分离纯化车间和微生物发酵、分离、冻干车间。
培养目标：掌握生物药物的生产、质量控制、设备维护等所必需的实践操作技能和基本理论知识，具有良好的职业素质和文化修养的高等技术应用型专门人才。
主要课程：生物化学及分子生物学、微生物学、免疫学、组织细胞培养技术、生物工程概论、生物药物检测技术、生物药物制剂技术、生物制药工艺、生物制药设备使用与维护、安全生产知识、实用药物学基础、生物药品等课程。
就业去向：医药行业，从事生物药物生产、质量检测、经营管理等岗位工作。