为适应现代医药卫生事业发展需要，依托东南大学相关药学、临床医学、管理学、法学等学科综合优势，经国家教育部批准，设立药事管理专业，授予理学学士学位。
药事管理专业是现代药学、管理学、法学、经济学等学科相互交叉结合的新兴特色专业，是现代药学学科的新兴分支和重要组成部分，该专业培养能熟练运用药事管理学科的相关理论和方法，研究药学实践和管理规律，具有对医药社会问题进行分析、评估、研究、解决基本能力的高级复合型人才。
毕业生可在各级药品监督管理部门、药品及食品检验部门、卫生行政管理部门、药品生产及流通企业、药房、医药科研院所、医疗卫生机构、社会保障部门等从事药品行政监督管理、药品质量控制、药品营销等工作，具有广阔的发展前景和就业优势。