上海大学计算机工程与科学学院的前身为始建于1988年由上海工业大学计算机工程系和上海科技大学计算机科学系联合成立的计算机学院。
该学院是在钱伟长校长亲切关怀下成立的上海市高校中第一所计算机学院。
1994年，随着新上海大学的诞生，联合成立的计算机学院正式命名为上海大学计算机工程与科学学院，上海科技高等专科学校计算机系和原上海大学计算机应用系也一起并入。
学院以培养具有扎实的计算机科学理论基础、有一定创新能力和实践能力、能从事计算机硬件和软件的开发、设计和研制等工作的高级科技人才为目标。
学院设有1个计算机科学与技术本科专业，设“高可信计算与信息处理”方向博士学位授予点，3个硕士学位授予点（计算机应用技术、计算机软件与理论和计算机系统结构）和2个工程硕士学位授予点（计算机技术、计算机软件工程）。
1990年以来，“计算机应用”学科连续4期被上海市教委列为重点学科进行建设，计算机学科被学校列为“211工程”重点发展学科。
学院师资力量雄厚，现有教职工108人，其中专任教师74人。
现有教授18名（其中博士生导师11名），副教授（含高工）26名，具有博士学位的教师33名，有9名教授担任了全国或上海市二级以上学术团体的领导职务，学院目前每年招收本科生270名左右、硕士研究生100名左右、博士生10名左右，还招收硕士留学生若干名。
学院坚持教学与科研相结合的原则，围绕高可信计算与信息处理及计算机系统集成的研究方向，积极开展高性能计算、网格技术、智能信息处理、软件形式化方法、网络与多媒体和容错计算等领域的科学研究。
学院设立了“先进计算和应用中心”及“网格技术研究室”等八个研究室，是上海市教委“高校网格技术E-研究院”的主体研究力量。
学院自成立以来，已完成或正在完成的国家级和省部级项目近200项。
在上海市科委的支持下，由李三立院士主持完成了集群式高性能计算机“自强2000”，标志着我院在并行计算机研究方面达到了国内的先进水平。
该项成果获2001年上海市科技进步一等奖。
目前集群式高性能计算机“上大自强3000”也已投入运行。
截止2004年底，学院共获国家、省、部（市）级科研成果奖30多项。
此外，学院还积极开展与国内外的学术交流，多次主办国际会议。
学院积极开展教学改革，努力使教学计划、课程设置、教学内容以及教学手段与方法能适应学科发展和人才培养的需求。
积极开展“面向21世纪计算机学科教育内容和课程体系改革”，“计算机系统结构与并行处理”课程被上海市教委授予上海市级“精品课程”并获得上海市教学改革成果一等奖。
近年来，新增专业选修课10多门，先后出版专业教材30多本。
为培养学生的创新和实践能力，学院鼓励学生参加各项科技竞赛，参与教师的科研项目，参与柯达公司组织的数字图像创意活动。
学院连续几年组队代表上海大学参加ACM国际大学生程序设计比赛，并且在全国大学生“挑战杯”科技作品比赛中获奖。
学院注重学生的个性教育，对强化班的学生或自学能力特别强的学生单列计划、因人施教。
学院培养的学生主要去向为上海地区或面向全国择业，主要从事计算机软硬件的系统设计开发、销售维护、信息服务及其他行业的计算机管理应用工作。
部分学生选择继续攻读硕士、博士学位或出国深造。