制药工程专业昆明理工大学制药工程学科有“药物化学”二级学科硕士点授予权和“制药工程”硕士点授予权,目前该学科队伍拥有教师16人,其中博士10人,教授5人,副教授4人。
本学科结合云南种类繁多的中药和天然药物资源，学科特色的定位是“突出区域天然药物资源的优势，重点发展天然药物深加工及其改性方向，强化建设制药工程学科理工特色”。
研究方向主要为：天然药物化学、药物合成及药物制剂、药物分析及药物化学。
培养目标：培养掌握化学、药学、制药工程等方面的基本理论知识和实践技能，具备药物合成、工艺设计与革新、新药研制与开发、剂型及制剂设计、工艺设计、质量控制及药物分析和工程设计等能力的高级专门人才。
主要课程：有机化学、生物化学、化工原理、天然药物化学、药剂学、药理学、药物分析学、药物化学、制药工艺学、制药设备与工艺设计。
就业方向：毕业生可分配到制药企业、研究所、学校、药监、药检部门等，能在医药、和生物化工等领域从事科学研究、技术开发、工艺设计及技术经济管理工作。