南开大学软件学院于2001年8月筹建，2002年1月正式成立，是首批经国家教育部、国家计委批准的国家示范性软件学院。
软件学院充分利用南开大学的综合资源，以创“国际先进、国内一流”为目标，秉承南开大学“允公允能，日新月异”的校训，坚持求真务实、开拓创新、共享合作，为国家培养经济结构战略调整和软件产业发展所急需的高层次软件人才。
经过10年的努力耕耘，学院建成了国家级特色本科专业“软件工程”。
2011凭借教学和科研实力，南开大学“软件工程”首批成功获得博士点授权一级学科，进而形成了本科、硕士和博士完整的人才培养体系。
学院通过采用国际先进的软件人才培养模式、科学的课程体系、引用优秀的教材保证学生的培养质量。
每年聘请海内外著名企业和大学的专家、教授授课，课程设置与国际接轨，课程内容面向软件市场和企业，强化实践教学，并提供优良的硬件条件和教学环境。
学院与Microsoft、IBM、BEA、Oracle、HP、SUN等多家跨国公司建立了良好的合作关系，共建学生实习基地，共建课程，共建联合实验室，全方位培养实用型、高层次、多面向的国际化软件人才。
学院教师的主要研究领域包括：智能机器人系统，数据库技术与应用，信息安全，嵌入式系统，多媒体技术，数据挖掘。
近年来承担了863、国家自然科学基金、天津市重点科技立项等多项重要的科研项目。
学院形成了自己鲜明的办学特色，人才培养成效显著。
学生在学期间除了学习软件基础知识和先进技术外，每个人都可以参加多个项目的研究开发，在包括大学生“挑战杯”竞赛、微软“创新杯”软件大赛、国家创新型大学生培养计划、全国机器人灭火比赛等活动中连创佳绩。
学院毕业生具有非常好的就业率以及起薪，主要就业方向为北京、上海、天津等地的IT优秀企业，银行、保险、税务等部门的软件开发与维护岗位。
近年来，随着滨海新区的开发和开放，许多毕业生也进入了位于新区的包括中海油、可口可乐、马士基等世界500强企业。
较高比例的学生被保送或者考取研究生。
最近几届毕业生中，出国深造的学生人数持续上升。