环境科学专业的本科生教育，以培养从事环境科学研究和管理的创新人才为目标，以“加强基础，淡化专业，因材施教，分流培养”为方针，采取“1+2+1”的三阶段培养模式，即大一按学科群打基础，二、三年级按一级学科（环境科学）培养，大四在老师的指导下，结合自愿的原则，选择少量必需的专业方向课（如环境生物地球化学、环境化学与环境毒理学、以及环境规划与管理等方向），着重培养学生“发现问题、提出问题、分析问题和解决问题”创新能力。
作为“地表过程教育部重点实验室”的主体，环境实验室建于1960年代中期，现有面积600平方米，拥有总价值达1000余万元的各类大、中型实验仪器；实验室面向本科生开放，使得这些学生能就国际前沿问题，尽早开展实验研究，为培养本科生的实验动手能力以及优秀学生的脱颖而出创造了有利条件。
基于这些研究，部分本科生在读期间能以第一作者在国外刊物上发表学术论文。